Este secretariado tiene definidas sus competencias en la dotación, mantenimiento y reposición de equipamiento docente y mobiliario, así como de la asignación de espacios a Departamentos, Centros y Servicios de la Universidad. Por otro lado, participa en el diseño de la ordenación de los Campus de la Universidad de Jaén conforme a criterios de sostenibilidad medioambiental, eficiencia energética y accesibilidad universal, planificando y supervisando la nuevas infraestructuras así como las mejoras en las existentes.