El sistema está especialmente concebido para ser implantado en almazaras, de manera que en el mismo participan una pluralidad de etiquetas (1-1’) con tecnología RFID, las cuales pueden disponerse entre las propias aceitunas, o bien fijarse a los diferentes remolques (2) utilizados en su transporte hacia la almazara, las cuales llevarán grabada una información interna acorde con el tipo de aceituna recogido, de manera que a la entrada de la almazara se establecen antenas (3) para lectura de dichas etiquetas asociadas a una base de datos (4) para almacenamiento y gestión de la información, identificando así el tipo de aceitunas que entran a la instalación y asignando al correspondiente remolque la tolva correcta de descarga. La instalación incorpora una serie de tolvas de recogida (6-6’-6’’-6’’’) junto a las que se dispone una segunda antena (7) de verificación del tipo de contenedor, con la particularidad de que en el caso de que las etiquetas (1-1’), se encuentren mezcladas con las aceitunas, se ha previsto que a la salida de las tolvas (8-8’-8’’) de descarga de los contenedores (9) de las aceitunas se disponga una serie de cintas transportadoras (11-11’-11’’), con una antena de lectura (10) asociada a cada una, mediante la que se comprueba la información de las etiquetas (1-1’) asociada a dichas aceitunas, de manera que si se detecta que alguna etiqueta no se corresponde con la línea en la que debería ir, se paraliza el sistema y se bifurca hacia otra cinta (12), de manera que dichas cintas (11-11’-12) comunican respectivamente con las tolvas de almacenamiento (13-13’-13’’) de cada tipo de aceituna perfectamente clasificado, a la salida de la cual se establecerá la línea de producción (14-14’-14’’) correspondiente.